PMA 是一种高亲和性的 DNA 结合染料,该染料本身具有微弱的荧光,但与核酸结合后可以发出更为明亮的荧光。它尤其与双链 DNA 具有高亲和性。PMA 不具有细胞膜渗透性,因此可选择性地修饰膜受损的死细胞的 DNA。PMA 修饰的 DNA 经蓝光 (~ 464 nm) 光解后,PMA 上的光反应性叠氮基转化为高反应性氮烯自由基,与 DNA 结合位点附近的任何烃部分反应形成稳定的共价氮碳键,从而导致永久性 DNA 修饰。该修饰过程会使 DNA 不溶,并使其在随后的基因组 DNA 提取过程中与细胞碎片一起丢失,进而阻碍死细胞中目标 DNA 的 PCR 扩增。残留在溶液中未结合的 PMA,在强光照射下与水分子反应分解成无交联活性的羟胺化合物,使羟胺不再能够共价结合 DNA,从而不影响 PCR 扩增。这个特性使得 PMA 可以通过实时定量 PCR (qPCR) 的手段,检测多种样本类型包括:细菌、生物膜、酵母、真菌、病毒和真核细胞;与 qPCR、NGS、Sanger 测序 LAMP 技术相结合,广泛应用在食品和水安全和环境测试中。